/genome
Анализ генетических данных по конкретному вопросу
> /plugin marketplace add artwist-polyakov/polyakov-claude-skillsHow it fires
How this command gets triggered: by you, by Claude, or both.
- Fires itselfClaude auto-loads it when your prompt matches the work.
- You can call itInvoke it directly when you want it.
- Slash command
/genome
Context preview
What this command does when you run it.
Анализ генетических данных по конкретному вопросу
Command definition
genome.mddescription: Анализ генетических данных по конкретному вопросу
argument-hint: <вопрос о генетике>
Genome Analysis Request
Проанализируй генетические данные пользователя по вопросу: **$ARGUMENTS**
VCF файл
VCF файл находится в текущей директории. Имя может быть любым (*.vcf).
Алгоритм выполнения
0. Найти VCF файл
Используй Glob для поиска VCF файла:
- `pattern`: `*.vcf`
Если найдено несколько — спроси пользователя какой использовать. Если не найден — сообщи об ошибке.
1. Исследование темы
Запусти агента для поиска релевантных SNP:
Task tool:
- subagent_type: "general-purpose"
- model: "sonnet"
- prompt: "Найди SNP (rsID), связанные с темой: $ARGUMENTS.
Используй WebSearch для поиска в GWAS Catalog, SNPedia, научных статьях.
Верни список rsID с описанием эффектов каждого аллеля (какой аллель рисковый/защитный)."
2. Поиск в геноме
Используй Grep для поиска найденных rsID в VCF файле (путь из Шага 0):
- Объедини все rsID через `|` в паттерн
- Путь: VCF файл найденный в Шаге 0
3. Интерпретация
Расшифруй генотипы:
- `0/0` = REF/REF (гомозигота по референсу)
- `0/1` = REF/ALT (гетерозигота)
- `1/1` = ALT/ALT (гомозигота по альтернативе)
4. Формирование отчёта
ВАЖНО: Отчёт должен быть визуально привлекательным! Используй этот шаблон:
## [Эмодзи] [Тема анализа]
### Основные результаты
| SNP | Ген | Твой генотип | Риск | Интерпретация |
|-----|-----|--------------|------|---------------|
| rs... | **GENE** | X/X | ✅/🟡/🔴 | Описание |
---
### 📊 Что это значит
**Твой профиль: [краткая характеристика]**
**Сильные стороны:**
- Пункт с объяснением
**Зоны внимания:**
- Пункт — что это значит на практике
---
### 🎯 Практические рекомендации
1. **Рекомендация** — почему важно
2. **Рекомендация** — конкретный совет
---
### 📈 Итоговая оценка
| Аспект | Оценка |
|--------|--------|
| ... | 🟢/🟡/🔴 |
---
⚠️ **Дисклеймер**: Генетика — вероятности, не судьба. Это информационный анализ, не медицинская консультация.
**Источники:** [SNPedia](https://snpedia.com), [GWAS Catalog](https://www.ebi.ac.uk/gwas/)
**Эмодзи для заголовков:** 🏃 спорт, ⚖️ вес, 🧠 психика, ☕ кофеин, 🍷 алкоголь, 🥛 питание, 💊 лекарства, ❤️ сердце
**Эмодзи для рисков:** ✅ защитный, 🟢 нейтральный, 🟡 умеренный, ⚠️ внимание, 🔴 высокий
Read more
description: Анализ генетических данных по конкретному вопросу argument-hint: <вопрос о генетике>
Genome Analysis Request
Проанализируй генетические данные пользователя по вопросу: **$ARGUMENTS**
VCF файл
VCF файл находится в текущей директории. Имя может быть любым (*.vcf).
Алгоритм выполнения
0. Найти VCF файл
Используй Glob для поиска VCF файла:
- `pattern`: `*.vcf`
Если найдено несколько — спроси пользователя какой использовать. Если не найден — сообщи об ошибке.
1. Исследование темы
Запусти агента для поиска релевантных SNP:
Task tool: - subagent_type: "general-purpose" - model: "sonnet" - prompt: "Найди SNP (rsID), связанные с темой: $ARGUMENTS. Используй WebSearch для поиска в GWAS Catalog, SNPedia, научных статьях. Верни список rsID с описанием эффектов каждого аллеля (какой аллель рисковый/защитный)."
2. Поиск в геноме
Используй Grep для поиска найденных rsID в VCF файле (путь из Шага 0):
- Объедини все rsID через `|` в паттерн
- Путь: VCF файл найденный в Шаге 0
3. Интерпретация
Расшифруй генотипы:
- `0/0` = REF/REF (гомозигота по референсу)
- `0/1` = REF/ALT (гетерозигота)
- `1/1` = ALT/ALT (гомозигота по альтернативе)
4. Формирование отчёта
ВАЖНО: Отчёт должен быть визуально привлекательным! Используй этот шаблон:
## [Эмодзи] [Тема анализа] ### Основные результаты | SNP | Ген | Твой генотип | Риск | Интерпретация | |-----|-----|--------------|------|---------------| | rs... | **GENE** | X/X | ✅/🟡/🔴 | Описание | --- ### 📊 Что это значит **Твой профиль: [краткая характеристика]** **Сильные стороны:** - Пункт с объяснением **Зоны внимания:** - Пункт — что это значит на практике --- ### 🎯 Практические рекомендации 1. **Рекомендация** — почему важно 2. **Рекомендация** — конкретный совет --- ### 📈 Итоговая оценка | Аспект | Оценка | |--------|--------| | ... | 🟢/🟡/🔴 | --- ⚠️ **Дисклеймер**: Генетика — вероятности, не судьба. Это информационный анализ, не медицинская консультация. **Источники:** [SNPedia](https://snpedia.com), [GWAS Catalog](https://www.ebi.ac.uk/gwas/)
**Эмодзи для заголовков:** 🏃 спорт, ⚖️ вес, 🧠 психика, ☕ кофеин, 🍷 алкоголь, 🥛 питание, 💊 лекарства, ❤️ сердце
**Эмодзи для рисков:** ✅ защитный, 🟢 нейтральный, 🟡 умеренный, ⚠️ внимание, 🔴 высокий